Nato nella prefettura di Yamanashi nel 1956. Laureato alla Tama Art University's Product Design Department nel 1980. Nello stesso anno è entrato a far parte di Seiko Epson, dove è stato responsabile della progettazione dello sviluppo avanzato. Nel 1989 si è trasferito negli Stati Uniti, dove si è unito alla ID Two (ora IDEO San Francisco), dove ha affinato il suo mestiere per sette anni. Nel 1996 è tornato in Giappone, dove ha fondato e diretto l'ufficio di Tokyo di IDEO. Nel 2003 ha fondato la NAOTO FUKASAWA DESIGN.
Attualmente, Fukasawa progetta per una vasta gamma di marchi leader in Italia e nel mondo. I suoi progetti spaziano in un'ampia varietà di campi, dall'elettronica di precisione, alle attrezzature per l'arredamento e gli spazi interni.
Con il conferimento del Premio Isamu Noguchi negli ultimi anni, è diventato evidente che i progetti di Fukasawa costituiscono una sublime bellezza di forma intrisa di potere del silenzio. Ha ottenuto riconoscimento internazionale non solo per i suoi progetti, ma anche per la sua capacità di raggiungere la vera essenza di un oggetto e per il suo pensiero e la sua espressione attraverso il design.
Fukasawa è professore del Dipartimento di Design Integrato presso la Tama Art University, siede nel comitato consultivo di design di Muji, ed è il direttore artistico di Maruni.
Nel 2006 ha fondato "Super Normal" con Jasper Morrison. È stato presidente del Good Design Award dal 2010 al 2014. Era nella commissione giudicatrice del Braun Prize 2012. Nel 2017 è diventato membro della commissione giudicatrice del Loewe Craft Prize. Gli è stato assegnato il titolo di Royal Designer for Industry (Royal Society of Arts).